梅斯特治疗的结果传开以后，各个地方被狂犬咬了的人，疯狂地涌到路易斯的实验室。治疗狂犬病要用的疫苗供不应求，必须要大量制做才行，所以路易斯实验室忙得不可开交。

治疗每天11点在路易斯的房间进行。

路易斯对于来接受注射的人，要一个一个查询被咬的日期和情况，然后写在记录簿里，这样便可随着治疗的进行，选用适当的疫苗。

对于来自乡下的人，他就介绍到研究室附近的旅馆，尽量让他们住得舒适。他特别关心怕注射的小孩，经常在桌子的抽屉里准备一些糖果、饼干。

有一天，一个37天前被狂犬咬了的少女前来接受治疗，脸上的伤已经化脓出血。

路易斯看了看少女，认为这个孩子没救了，不久之后就会死于狂犬病，现在才过来，为时已晚，即使注射也没用，就算替她注射，仍旧不免一死，这样还会使人们失去对狂犬病治疗法的信心。与其施救，倒不如放弃治疗。

但是面对少女的恳切哀求的父母，怎么能够忍心拒绝呢？路易斯只能说：“我尽可能试试看，不过恐怕是没救的，我就尽尽人事吧！”路易斯有一颗超乎常人的爱心。

接受治疗后的少女，一时间很有起色，路易斯看到了一丝希望，他想也许少女还有救，但是这希望没有持续多久。最终，她还是没能得救。

除了这个来不及施救的少女之外，所有的治疗都成功了。只要是被狂犬咬时间不长的，都可以完全地防止病症的发作。

从1885年11月起到1886年2月底止，路易斯一共治疗了350人，死亡的仅仅1人，就是那位来晚了的少女。

以往谁也无法治疗的狂犬病，已经可以治疗了，这是科学上的辉煌胜利。路易斯将这一事实报告科学院，并建议：“狂犬病预防法已经确立，应该设立狂犬病预防疫苗的接种所。”

路易斯的研究室面积不大，又没有医疗设备，这产生了诸多不便，为此，有必要建立新的诊疗所。

科学院马上采纳了路易斯的意见，为了促其早日实现，还设立了委员会。

路易斯对于这一计划的希望是：不求国家援助，可以采用捐款方式在巴黎建造模范医院。所以委员会决定着手募款，除了治疗狂犬病以外，同时可作为传染病的研究中心，并决定命名为“巴斯德研究所”。

捐款运动马上推展到了法国的各个角落，不久更扩展到国外。商人、学生、工人等各阶级的人以及各社团捐献的钱款，陆续不断寄来。

捐赠人的姓名报纸上都有发表。路易斯看到一份阿尔萨斯地方报，不禁眼前一亮，因为他发现了他最先救治的约瑟夫·梅斯特的名字。这位少年本是贫农的儿子，他竟然把微少的零用钱储存起来作为捐款，数目虽小，但情意诚挚，这让路易斯感动不已。

在高等师范学校内的路易斯的研究室，仍然继续治疗被狂犬咬到的人。有的居然远从美国、俄国赶来接受治疗，虽然因为长途跋涉延迟了一些时间，但是后来都治愈了。

现在已经有许多路易斯的学生和医生参加狂犬病的治疗，路易斯本来可以放心地让他们去做，但他每天一定要到研究室工作，一天也不肯休息。

1887年10月23日上午，路易斯在房间里写好了信，刚想跟妻子讲话的时候，突然说不出话了。这次又是脑溢血发作，致使他的舌头麻痹。从此之后，路易斯的舌头一直都是卷着的，他再也发不出以前那种铿锵有力的声音了。